В 2005 году вышел Final Fantasy VII: Advent Children — второй полнометражный анимационный фильм в истории серии. В отличие от дорогого и едва не похоронившего Square фильма The Spirits Within, Advent Children оказался успешным. Значительно выросший уровень технологий позволил сократить бюджет и притом не потерять в качестве. Кроме того, Square Enix воздержалась от широкого кинопроката, выпустила фильм прямиком на DVD и в формате UMD для просмотра на консоли PSP. В 2009 году вышла режиссёрская версия в формате Blu-ray. Она могла похвастаться улучшенной графикой, детализацией и спецэффектами, содержала дополнительные сцены общей продолжительностью более 25 минут и шла в комплекте с демоверсией Final Fantasy XIII.
Фильм должен был стать первым проектом подсерии, задать ей тон, но в итоге вышел позже, чем Before Crisis. Всё потому, что Advent Children — по задумке 20-минутная сюжетная короткометражка — в процессе производства разросся до размеров полнометражного кино. Фильм, отличавшийся множеством ярких экшен-сцен, продолжал историю Final Fantasy VII, а главными героями в нём были самые популярные персонажи игры — Клауд, Тифа и Сефирот. Коллекционное издание фильма, выпущенное тиражом в 77 777 экземпляров, комплектовалось короткометражным аниме Last Order: Final Fantasy VII от студии Madhouse.
Кроме того, во время продвижения Advent Children и Advent Children Complete сценарист Казусиге Нодзима написал три рассказа о событиях, происходивших в двухлетнем промежутке между завершением оригинальной игры и началом фильма: «Дело Дэнзела», «Дело Тифы» и «Дело Баррета». Впоследствии их издали в сборнике под названием On the Way to a Smile: Final Fantasy VII. Одна из историй, «Дело Дэнзела», была также экранизирована в виде 28-минутного аниме On the Way to a Smile: Episode Denzel и входила в состав всех изданий в формате Blu-ray с финальной версией фильма. А в 2011 году Нодзима написал роман Final Fantasy VII. Lateral Biography Turks: The Kids Are Alright.
В 2006 году на PlayStation 2 вышла ещё одна игра подсерии — Dirge of Cerberus: Final Fantasy VII, рассказывающая о событиях, случившихся через три года после завершения Final Fantasy VII. Ведущими персонажами игры стали Винсент и Юффи, раскрытию которых в оригинале (по мнению Тецуи Номуры) уделялось недостаточно внимания. Впрочем, остальные сколько-нибудь важные персонажи, уцелевшие в ходе событий Final Fantasy VII, тоже появляются в сиквеле. Игра относилась к крайне необычному для Square Enix жанру шутера. Она также была одной из немногих игр для PlayStation 2, полноценно поддерживающих клавиатуру и мышь. Японская версия содержала режим сетевой игры, но из-за низкой популярности его не стали включать в версии для США и Европы, взамен добавив 40 дополнительных одиночных миссий.