По атмосфере игра тоже стала, с одной стороны, ярче и красочнее оригинала, который местами был буквально серо-коричневым, с другой — одновременно и темнее, и мрачнее. Так, почти курьёзно-комический эпизод, в котором приходится играть за Эшли, стал весьма пугающим приключением в почти полной темноте. При этом, если раньше структурно всё чётко делилось на главы, из-за чего пропадала возможность возвращаться в прежние зоны, Resident Evil 4 действует в рамках полуоткрытого мира, который можно достаточно свободно исследовать по уже пройденным тропкам.
Не изменились разве что довольно банальные загадки, ставшие практически атавизмом сериала Resident Evil. В ремейке их, кажется, навалили ещё больше, и они практически не приносят удовольствия при решении. Все эти сборы фигурок и ключей, пятнашки и задачки в духе «покрути эту фиговину так, чтобы изображение на картинке совпало», хоть и служат символом RE, здесь раздражают чуть ли не сильнее, чем в оригинале.
Зато элемент исследования в новой Resident Evil 4 — буквально лучший во всём сериале. Гулять по местным закоулкам, разыскивая сокровища и ресурсы, благодаря прекрасному дизайну локаций и удобной карте не только полезно, но и приятно. Знаменитый бродячий торговец теперь не только обменивает найденные богатства на амуницию, но и выдаёт небольшие квесты. Охота на крыс или стрельба по синим медальонам иногда прилично ломают дикий темп игры, зато вознаграждают шпинелями — раньше эти камушки конвертировались исключительно в песеты, а теперь служат для покупки самых редких улучшений.