На втором «финальном» турнире к сборной Земли присоединились Джексон Бриггс, он же Джакс, — вышестоящий офицер Сони, индейский шаман Ночной Волк, полицейский Кёртис Страйкер, Куай Лиэн — младший брат Саб-Зиро с прошлого турнира, и принцесса Китана, узнавшая правду о своих родителях. Подготовился и Шао Кан: предвидя предательство Китаны, он приказал Шан Цуну создать клон приёмной дочери, Милину. На турнире от Внешнего Мира сражался телекинетик Ермак — вместилище тысячи душ, а также роботизированные ниндзя из клана Лин Куэй Сектор и Сайракс. Лю Кэну удалось выиграть и это состязание, победив самого Шао Кана.
От смертельной битвы к войне за выживание
Казалось бы, здесь история должна была закончиться — Земное Царство победило, Шао Кан повержен, пришло время мира и покоя? Не тут-то было: поражение Шао Кана не обернулось его смертью. Турнир во Внешнем Мире оказался лишь звеном в длинной цепочке событий, за которым последовало возвращение из Преисподней Шиннока, воскрешение Онаги, гибель Лю Кэна и, наконец, исполнение пророчества об Армагеддоне. Пробудился огненный элементаль Блэйз, победа над которым давала безграничную мощь, и заполучил её Шао Кан. В финальной битве между императором и Рейденом бог грома проиграл. Последнее, что он успел перед смертью, — отправить самому себе в прошлое послание: «Он должен победить!»
Вместе с посланием появились видения обо всех ключевых событиях будущего. Рейден попытался повлиять на них, но ни к чему хорошему это не привело. Он предложил Скорпиону пощадить первого Саб-Зиро, Би-Хана, и пообещал в этом случае попросить у Старших богов помощи в возрождении истреблённого клана Сирай Рю. Скорпион почти согласился, но появился колдун Куан Чи и показал ему иллюзию убийства Саб-Зиро, его клана и семьи. История повторилась — Скорпион казнил Саб-Зиро. Бог грома предвидел, что киборгизация клана ниндзя Лин Куэй приведёт к их попаданию в руки Шао Кана, и попытался отговорить от участия в проекте Сайракса и спасти Смоука.