В новой части цикла бравый герой разбирается сразу с несколькими сюжетными завихрениями.
Первое из них — личное. Если в «Мегиддо» появлялись лишь намёки на романтику, то «Индиго» может похвастаться полноценным любовным треугольником. Правда, как это часто бывает у Лукьяненко, со своими закавыками. Бедный Максим мечется между двумя женщинами. Дамы сердца здесь как на подбор — понимающие, благородные и вообще готовые к отношениям на троих. Любовные метания Максима выглядят притянутыми за уши, драма — искусственной, отчего ветвистая романтическая линия кажется лишней.
Второе — детективное. В целом Лукьяненко неплохо удаются подобные истории — вспомним хотя бы серию «Кваzи». Так что основная детективная линия, посвящённая расследованию смерти одного из Продавцов, получилась крайне увлекательной. Автор создал интересный вид пришельцев, с оригинальной мотивацией и анатомией. Столь свежий взгляд на киборгов как на разумную расу и послужил причиной того, что этот сюжетный элемент кажется чуть ли не главным достоинством книги.
Третье — «смысловое». Максиму и нам, читателям, прямо говорят, почему Избранным стал именно он. А это в таких историях случается нечасто. Радует и то, что ответ герою даёт не какой-то «бог из машины», чем иногда грешит Лукьяненко, но сам Максим. Он ищет ответы внутри самого себя — и ведь находит! А значит, и ответственность за решения, которые станут судьбоносными не только для всех героев, но и для Земли, лежит только на нём.
Второстепенные герои на этот раз играют очень ограниченную роль. Большинство из них проявили себя в первой книге и теперь лишь помогают Максиму двигаться по сюжету. Без потерь не обходится, однако тот же Лихачёв остаётся в строю, сохранив свои залихватские замашки. Старики-разбойники от него не отстают, ну а Изменённые по-прежнему верны себе: каждый первый мечется между своей инородной сущностью и остатками человечности.
В целом книга существенно развила темы первой части — здесь и «туземная» философия, и определение места человечества в многогранной Вселенной, и поиски ответа на главный вопрос: чем же закончится противостояние со всесильными пришельцами, если против них выступает один лишь Максим Воронцов?